Анотація до роботи:

Скрипкiна I.Я. Характеристика нових генiв 21-ої хромосоми людини та виявлення їхнiх гомологiв у мишi. - Рукопис.

Дисертацiя на здобуття наукового ступеня кандидата бiологiчних наук за спецiальнiстю 03.00.03 молекулярна бiологiя. - Iнститут молекулярної бiологiї i генетики НАН України, Київ, 2003.

Дисертацiйна робота присвячена аналiзу трьох генiв людини, кДНК яких були попередньо картованi на довгому плечi 21-ої хромосоми людини, а також пошуку та порiвняльнiй характеристицi їхнiх гомологiв у мишi, що необхiдно для подальшого дослiдження ролi цих генiв у розвитку синдрому Дауна та супутнiх хвороб. В результатi проведеної роботи було одержано новi кДНК генiв аргiнiн-N-метилтрансферази 2 (HRMT1L1), нового ядерного бiлка (NNP-1) та iнтерсектину 1 (ITSN1) мишi. B результатi скринiнгу геномної бiблiотеки селезiнки мишi та аналiзу отриманих послiдовностей вперше визначено повну нуклеотидну послiдовнiсть гена нового ядерного бiлка (NNP-1) мишi. Використовуючи отриманi нами кДНК- i геномнi послiдовностi дослiджуваних генiв та нуклеотиднi послiдовностi мишi i людини, якi представленi в нуклеотидних базах даних, нами були визначенi структури генiв HRMT1L1, NNP-1 i ITSN1 людини та їхнiх гомологiв у мишi. Вперше показано змiну рiвня експресiї гена аргiнiн-N-метилтрансферази 2 людини в рiзних тканинах у процесi ембрiогенезу за допомогою Нозерн-аналiзу. Встановлено, що рiвень експресiї генiв HRMT1L1 та NNP-1 iдентичний в тканинах нормальних i трисомних мишей (Ts65Dn), що може вказувати на вiдсутнiсть їхнього функцiонального значення для розвитку синдрому Дауна. За допомогою ЗТ-ПЛР виявлено новi iзоформи транскриптiв генiв iнтерсектину 1 людини i мишi. Показано їхню тканинну i вiкову специфiчнiсть.

Ключовi слова: хромосома 21, аргiнiн-N-метилтрансфераза 2, новий ядерний бiлок, iнтерсектин 1, експресiя генiв, гомологiя генiв, альтернативний сплайсинг, транскрипцiйнi iзоформи, ЗТ-ПЛР, синдром Дауна.

1. Встановлено i охарактеризовано будову генiв аргiнiн-N-метилтрансферази 2 (HRMT1L1), нового ядерного бiлка (NNP-1) та iнтерсектину 1 (ITSN1) людини, якi картовано на довгому плечi 21-ої хромосоми, та їхнiх гомологiв у мишi.

2. Отримано та визначено нуклеотиднi послiдовностi нових кДНК генiв HRMT1L1, NNP-1 та ITSN1 мишi, якi гомологiчнi генам людини, що картованi на 21q.

3. Вперше визначено нуклеотидну послiдовнiсть, яка мiстить ген нового ядерного бiлка (NNP-1) мишi.

4. Дослiджено експресію гена аргiнiн-N-метилтрансферази 2 у людини та мишi (HRMT1L1) i встановлено її тканиноспецифічний характер. Для гена людини вперше показано змiну рiвня експресiї в рiзних тканинах у процесi ембрiогенезу.

5. Показано присутнiсть транскрипту гена нового ядерного бiлка (NNP-1) мишi в ycix дослiджуваних тканинах i однаковий рiвень його експресiї протягом життя тварини, що свiдчить про належнiсть цього гена до генiв “домашнього господарства”.

6. Вперше встановлено, що рiвень експресiї генiв HRMT1L1 та NNP-1 є iдентичним y тканинах нормальних i трисомних мишей (Ts65Dn), що передбачає вiдсутнiсть їхнього функцiонального значення для розвитку синдрому Дауна.

7. Iдентифiковано пять нових, утворених за рахунок альтернативного сплайсингу, iзоформ транскриптiв гена iнтерсектину 1 людини i мишi, що функцiонально повязаний з ендоцитозом та сигнальними шляхами в клiтинi. Показано їхню тканинну та вiкову специфiчнiсть.

Публікації автора:

1. Скрипкина И.Я., Цыба Л.А., Славов Д., Кваша С.М., Гардинер К. и Рындич А.В. Получение и характеристика мышиного гена, гомологичного Nnp-1 гену человека, картированному на участке хромосомы 21 q22.3 // Биополимеры и клетка. - 2000. - Т.16, №6. - С.530-539.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК гена нового ядерного бiлка людини; ізолювання та характеристика кДНК гена нового ядерного бiлка мишi; iдентифiкацiя геномних послiдовностей, якi мiстили ген нового ядерного бiлка мишi; компютерний аналіз та порiвняльна характеристика нуклеотидної послідовності генiв нового ядерного бiлка людини i мишi.

2. Скрипкина И.Я., Цыба Л.А., Аноприенко О.В., Смалько В.П., Славов Д., Гардинер К. и РындичА.В. Строение HRMT1L1 гена человека, картированного на участке хромосомы 21 q22.3, и его мышиного гомолога (Prmt2) // Доповiдi Нацiональної академiї наук України. - 2001. - №8. - С.167-172.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК гена аргiнiн-N-метилтрансферази 2 людини; характеристика кДНК гена аргiнiн-N-метилтрансферази 2 мишi; компютерний аналіз та порiвняльна характеристика нуклеотидних послідовностей генiв аргiнiн-N-метилтрансферази 2 людини i мишi; визначення експресії гена в різних тканинах ембрiонiв людини за допомогою Нозерн-аналiзу.

3. Скрипкина И.Я., Цыба Л.А., Славов Д., Гардинер К. и Рындич А.В. Новые формы транскриптов гена интерсектина человека и мыши // Український бiохiмiчний журнал. - 2002. - Т.74, N4. C.33-43.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; компютерний аналіз та порiвняльна характеристика нуклеотидних послідовностей генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; визначення експресії гена в різних тканинах ембрiонiв людини та дорослих мишей шляхом ЗТ-ПЛР; отримання i аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 мишi; аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 людини.

4. Skripkina I.Ya., Tsyba L.A. Identification of mouse homologues of some genes mapping on human chromosome 21 // Conference for students, PhD students and young scientists “Molecular biology and genetics”. - Kyiv (Ukraine). - 2001. - P.168.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК генiв HRMT1L1, NNP-1 та ITSN1 людини i мишi; ізолювання та характеристика кДНК гена NNP-1 мишi; компютерний аналіз та порiвняльна характеристика нуклеотидних послідовностей дослiджуваних генiв людини i мишi; визначення експресії генiв HRMT1L1 та ITSN1 в різних тканинах ембрiонiв людини та дорослих мишей; отримання i аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 мишi; аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 людини.

5. Скрипкина И.Я., Цыба Л.А., Рындич А.В. Альтернативный сплайсинг пре-мРНК гена интерсектина: видовая и тканевая специфичность // 6-я Пущинская школа-конференция молодых ученых “Биология - наука XXI века”. - Пущино, (Россия). - 2002. - С.324.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; визначення експресії гена в різних тканинах дорослих мишей шляхом ЗТ-ПЛР; отримання i аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 мишi; аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 людини.

6. Tsyba L., Skripkina I., Slavov D., Rynditch A., Gardiner K. Diversity in gene expression: alternative splicing in intersectin 1 pre-mRNA important in cell signaling // HUGOTs Seventh International Human Genome Meeting, HGM2002. - Shanghai (China) - 2002. - P.149.

Особистий внесок дисертанта - визначення екзон-iнтронної будови генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; визначення експресії гена iнтерсектину 1 в різних тканинах ембрiонiв людини та дорослих мишей шляхом ЗТ-ПЛР; отримання i аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 мишi; аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 людини.

7. Tsyba L., Skripkina I., Kvasha S., Lazurkevich Z., Rynditch A. Alternative processing of gene transcripts in pathology // 4rd Parnas Conference. - Wroclav (Poland). - 2002. - P.26.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; компютерний аналіз та порiвняльна характеристика нуклеотидних послідовностей генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; визначення експресії гена в різних тканинах ембрiонiв людини та дорослих мишей шляхом ЗТ-ПЛР; отримання i аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 мишi; аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 людини.

8. Skripkina I. Ya., Tsyba L. A., Slavov D., Gardiner K. and Rynditch A. Diversity in gene expression: Alternative splicing of pre-mRNA important in cell signaling // 4rd Parnas Conference. - Wroclav (Poland). - 2002. - P.73.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; компютерний аналіз нуклеотидних послідовностей генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; визначення експресії гена в різних тканинах ембрiонiв людини та дорослих мишей шляхом ЗТ-ПЛР; отримання i аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 мишi; аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 людини.

9 Циба Л.О., Скрипкiна I.Я., Ференець Г. О, Риндич А.В. Альтернативний сплайсинг пре-мРНК гена iнтерсектина: видова i тканинна специфiчнiсть / Матерiали VIII Українського бiохiмiчного зїзду // Український бiохiмiчний журнал. - 2002. - Т.74, N4б (додаток 2). - Чернiвцi (Україна). - С.14-15.

Особистий внесок дисертанта - характеристика кДНК генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; компютерний аналіз та порiвняльна характеристика нуклеотидних послідовностей генiв iнтерсектину 1 людини i мишi; визначення експресії гена в різних тканинах ембрiонiв людини та дорослих мишей шляхом ЗТ-ПЛР; отримання i аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 мишi; аналiз нових iзоформ гена iнтерсектину 1 людини.